再请假三天却被扣了六天工资，这合法吗？

不合法。请假三天被扣六天工资违反《劳动法》，用人单位不得无故克扣员工工资。若因此导致报酬不足额支付，可申请仲裁，不服裁决的可起诉。不及时处理，员工权益将持续受损。
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常见处理方式为与用人单位协商、向劳动部门投诉或申请劳动仲裁。应先尝试与用人单位沟通解决；沟通无果的，再向劳动部门投诉或申请仲裁。根据具体情况选择最合适的处理方式。
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不合法。处理方式：1.与用人单位协商，要求合理扣发工资；2.协商不成，向当地劳动部门投诉，请求处理；3.仍无法解决，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；4.对仲裁裁决不服，向法院提起诉讼。